Les espèces menacées constituent une grande part de notre flore (environ 1/3 de la flore suisse est mencé). Dès le début, la CPS était obligée de fixer des priorités en se concentrant d'abord sur les espèces qui nécessitent des mesures urgentes et sur les espèces qui ont une importance internationale.

En 1992, la CPS a élaboré, sur la base de la Liste rouge de 1991 (E. Landolt) et de divers documents européens, une première liste prioritaire avec environ 40 espèces de Suisse, menacées et rares au niveau européen.

En 1997, un groupe d'experts CPS/CRSF y a ajouté des espèces menacées au niveau national pour établir une liste globale avec environ 700 espèces prioritaires pour la Suisse. 142 espèces de cette liste globale ont fait l'objet de recherches détaillées (voir fiches pratiques pour la conservation).

En 2007, le CRSF a révisé la liste prioritaire sur mandat de l'OFEV (Office fédéral de l'environnement). Cette liste est basée sur une nouvelle méthodologie et emploie

• le statut de la Liste rouge 2002 (CRSF) appliquant les nouvelles catégories de menace de l'UICN,

• la responsabilité au niveau international de la Suisse vis-àvis des espèces indigènes, soit la part suisse de l'aire de distribution globale et le degré d'endémisme (Eggenberg, S. & Landolt, E.; 2006; Für welche Pflanzenarten hat die Schweiz eine internationale Verantwortung; Bot. Helv. 116/2: 119-133).